北海道大学博士毕业难吗？
作为在北海道大学（Hokkaido University，以下简称HU）理工校区（Tohoku Campus）度过了8年研究生和10年教职生涯的外国留学生，以下回答仅从理工科角度阐述北海道大学的博士考试情况；人文社科类的同学们还请轻拍。 先说一下总体情况。日本的所有国立大学都是申请制（除一部分工科专业外，比如生化环材这些传统的工学院系），而不是像国内一样考笔试加面试。因此能否通过博士入学考试的最终结果取决于教授的个人意见。当然如果有教员撑腰那就另说了.... 以我的经验来看，教授的个人意见主要受两个因素影响：第一个是你在报考这个研究室的时候写的志望理由（研究计划书）；第二个是你的研究设想是否符合这个研究室的现有实力、以及是否能有助这个研究室在未来获取研究成果。
举个例子：我在报考HU的研究生时（2007年），由于我对生物学的兴趣使然，想加入一个生物学的研究组。但是由于我当时本科非生物学专业且英语一般，能够申请的研究生项目非常少。于是我就向几个可以接受外国人研究生的教授发了邮件。其中有两个教授的回信非常慷慨热情，并且给出了详细的解答。一个是现在的恩师，另一个则是我现在的老板。
然而当我正式提交研究生申请材料的时候，我却选择了恩师，因为老板当时的答复稍微有点冷淡。后来我才知道，原来当时老板虽然回复了我的邮件，但是并不愿意为我破例录取。而恩师恰好是例外之一，他非常喜欢我的研究计划并认为我的理论基础扎实、知识结构完整，很适合开展他的研究。所以最后我被恩师收为研究生，并在两年后顺利升了博士。
再来说说具体的情况。首先申请日本国立大学的研究生（修士预科）是没有名额限制的，也就是说你完全可以同时申请多个学校多个专业，直到收到录取通知书为止。这里需要说明的是，日本的研究生不同于中国的研究生，它不是在职学习性质的，而是脱产学习的，也就是说你如果申请了日本的研究生，就需要放弃你原先的工作/学业来到日本继续你的进修。
另外需要说明一点的是，在日本所有大学的所有学科里面，除了法学、政治学等少数文科专业以外，几乎所有的理工科专业都是对外国留学生开放。
接下来谈谈研究计划书（即中国所说的硕士论文），这一点正如 @李硕说过 的答案所讲的，是需要有创新点的，否则很难得到积极的回应。
另外还有一点提醒，任何研究计划的内容最好和你的研究设想相吻合，因为你的研究计划最终是要支持你的研究设想的。不然的话会让教授觉得你毫无布局和能力去执行你的研究设想，自然不会给你好脸色。 至于面试，有的学校会有，有的是笔试+面试的形式，也有的是完全的无领导小组讨论。具体形式因校而异。不过不管是什么形式的考试，语言能力都是最重要的一个因素。如果你日语流利、英语流利并且专业知识扎实，通过考试的几率自然会大很多。